ANALISIS SEKUEN NUKLEOTIDA E/NS1 GENE JUNCTION VIRUS DENGUE SEROTIPE 2 ASAL DKI JAKARTA, INDONESIA

Abstract

Demam dengue atau demam berdarah dengue merupakan salah satu masalah
kesehatan di daerah tropis dan subtropis. Penyakit ini disebabkan oleh virus dengue
(genus flavivirus, famili flaviviridae). Vektor pembawa virus dengue adalah nyamuk
Aedes aegypti dan Aedes albopictus. Genom virus dengue tersusun atas tiga protein
struktural (protein nukleokapsid, protein envelope, dan protein pre-membran) dan tujuh
protein nonstruktural (NS1, NS2a, NS2b, NS3, NS4a, NS4b, dan NS5). Usaha untuk
mengontrol penyakit ini tergantung pada pemahaman patogenesis virus dengue. Tetapi
pengetahuan mengenai patogenesis virus dengue masih belum banyak diketahui karena
belum adanya model yang cocok baik in vitro maupun in vivo. Sehingga dilakukan
analisis sekuen nukleotida E/NS1 gene junction virus dengue tipe 2 asal DKI Jakarta,
Indonesia untuk mengetahui hubungan filogeni virus dengue yang beredar saat ini.
Sekuen nukleotida (240 bp) dari E/NS1 gene junction merupakan segmen yang biasa
digunakan untuk analisis perbandingan sekuen. Hasil analisis menunjukkan strain virus
yang diteliti berkerabat dengan virus DEN-2 asal Asia yaitu Myanmar, Pakistan, Sri
Lanka, Brunei, dan Malaysia. Tetapi kelima virus ini berada dalam kelompok yang
berbeda dengan virus asal Amerika latin (Brazil). Virus Dengue dari Asia diduga lebih
virulen dibandingkan virus dengue dari daerah lain. Sehingga kemungkinan terjadi
peningkatan kasus DBD di Indonesia.
Kata kunci: Virus Dengue, E/NS1 gene junction, serotype, filogeni, DEN-2